事情原来是这样的：峨眉山上有个破庙里，住着逃荒的母女二人，母亲有病，女儿年十六岁，名叫灵芝。这姑娘长得心灵手巧，勤劳善良，为了维持生活，姑娘天天到山上采蘑菇，再拿到山下城里去卖，赖以活命。时间长了，姑娘有了采蘑菇的经验，不但知道山上哪儿的蘑菇多，而且知道怎样的蘑菇好吃，还学会了养殖菇。她把一些朽木搬到背阴的庙后面，浇上水，过些时候就长出了鲜嫩的蘑菇。这样即使天阴下雨有啥事耽误，她也能采到蘑菇。她的蘑菇卖得很便宜，买的人也不少，慢慢同买的人就熟悉起来。有时候卖不完，就把蘑菇晒干放起来，以便冬天再卖。
有一天姑娘在山林深处的一棵枯树下，发现了三棵像蘑菇似的异样东西。那东西样子像小伞，伞盖有碗口大，伞把有半尺长，颜色又红又紫，有油漆一样的光亮。姑娘喜出望外，用手一摸，有一种不像是蘑菇的感觉， 立即采了下来，可是这能不能吃? 会不会有人买?姑娘犹豫不决，最后还是将它扔到了地上。过了几天，她又到了那棵树旁，发现那三个异样的蘑菇仍在地上，就又捡了回来。到城里去卖蘑菇时也顺便把那三个东西带去，人们一见，这个摸摸，那个捏捏，又都放下，没有人买。姑娘拿去城里几回都没卖掉。
冬天，大雪纷飞的一天，姑娘提着半篮子干蘑菇到城里去卖，又把那三个异样东西带去。严寒天冻，姑娘大半天才算卖完了蘑菇，正准备回家时，一个小伙子气喘吁吁地跑来买蘑菇。他父亲病了好几年，目前病危。忽然想吃蘑菇，为了尽孝道，以满足即将离世老人的心愿，才急急忙忙跑来买蘑菇。不料姑娘已将蘑菇卖光了，就只剩下那三个像蘑菇的异样东西，小伙子便买了下来，又急忙赶回家。家人立即熬好蘑菇汤，可是老人已经叫不醒了， 昏昏迷迷，气息奄奄。为了让老人临终前吃到想吃的东西，家人就用小勺顺着老人的牙缝一点一点地缓缓灌下去。说来也奇怪，老先生昏迷了一夜，第二天居然醒过来了。家人又继续喂他“蘑菇”汤，一连喂了三天，老人的病奇迹般地好起来，后来又经精心照顾能够下床，还能到街上转悠了。
孙思邈听了这件奇异的事情，决心寻找这神奇的异物。他找到买蘑菇的小伙子，一起上山探访了灵芝姑娘，把她采到异物的情况和那异物的样子全都详细记了下来。天气转暖后，孙思邈就同徒弟们上山去寻找那异样的蘑菇。从春到夏，从夏到秋，工夫不负有心人，这东西终于找到了。孙思邈就用此物发现者----那位姑娘的名字取名为“灵芝”，又称“灵芝草”。
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